O Museu de História Natural Louis Jacques Brunet é um museu escolar, da segunda metade do século XIX. Leva o nome de seu fundador, um médico naturalista francês, o qual lecionou na segunda turma de Ciências Naturais do Ginásio Pernambucano e foi responsável pela formação das primeiras coleções do museu. A escola teve duas datas importantes, a de sua fundação, em 1825, conhecida como Liceu Provincial de Pernambuco e a segunda em 1855 quando veio a chamar-se Ginásio Pernambucano, construído na rua Aurora.
O funcionamento atual do Museu ocorre no primeiro pavimento da EREM (Escola de Referência em Ensino Médio) do Ginásio Pernambucano, no bairro de Santo Amaro, em Recife, Pernambuco. No Ginásio estudaram personalidades e figuras proeminentes do Brasil, como a escritora Clarice Lispector, o escritor Ariano Suassuna, o teatrólogo Valdemar de Oliveira, o empresário Assis Chateaubriand, o cientista Josué de Castro e Epitácio Pessoa, ex-Presidente da República (1919-1922). O projeto inicial do Ginásio Pernambucano foi alterado, sendo construído inicialmente apenas um pavimento. Posteriormente, foi erguido um pavimento superior. Mesmo assim o Ginásio da rua Aurora está entre os prédios mais majestosos da cidade, sendo o mais antigo colégio do país em atividade. Está sob a salvaguarda do Instituto do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional – IPHAN, com tombamento inscrito em 1984; atualmente, o museu funciona no primeiro pavimento do prédio, sob a responsabilidade direta da Secretaria de Educação de Pernambuco - SEDUC-PE, da Fundação do Patrimônio Histórico e Artístico de Pernambuco - Fundarpe e do IPHAN.
Demais tipologias de acervo: Artístico, Arqueológico, História, de Ciências e Tecnologia e de Ciências Naturais.
A Mobília do Museu é tombada pelo Governo do Estado de Pernambuco.
Há alguns objetos indigenas sem identificações precisas.
