A tipologia do acervo do Museu Náutico é histórico.
A Universidade Federal do Rio Grande - FURG tem por regimento uma escolha prioritária pelo mar. Nesse sentido, tem sido particularmente significativa o auxílio de seu Complexo de Museus e Centros Associados, tanto por meio de exposições permanentes e itinerantes quando pela sua capacidade de dialogar com a comunidade, acrescendo-lhe a vontade de descobrir o mundo oceânico e mobilizando-a para a defesa do patrimônio marítimo costeiro nacional.
O Complexo de Museus, formado pelo Museu Oceanográfico ""Eliézer de C. Rios"", Museu Antártico, Eco-Museu da Ilha da Pólvora e Museu Náutico, complementam a missão da Universidade, tanto no que se refere a formar professores e estudantes quanto a
extensão, cultura e a pesquisa e está vinculado, na estrutura organizacional, à Pró-Reitoria de Extensão e Cultura – PROEXC.
